歐冠聯賽階段第8輪，本菲卡主場4-2擊敗皇家馬德里，穆里尼奧帶領開局四連敗的本菲卡以第24名晉級歐冠淘汰賽附加賽。

本菲卡在本賽季歐冠聯賽階段首輪主場2-3輸給了卡拉巴赫，在穆里尼奧接手后，本菲卡前三場歐冠同樣遭遇失利，先后輸給切爾西、紐卡斯爾聯和勒沃庫森。

遭遇開局四連敗的本菲卡在第5輪2-0擊敗阿賈克斯收獲首勝，第6輪主場2-0戰勝那不勒斯。第7輪客場0-2輸給尤文圖斯。

最終穆里尼奧的球隊在第8輪主場4-2擊敗本輪開打前排名第三的皇馬，以9分獲得第24名，晉級歐冠淘汰賽附加賽。